Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK3Q00526 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK3Q00526 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms