Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA4P83105 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTRA4P83105 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms