Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX3P78415 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX3P78415 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX3P78415 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX3P78415 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX3P78415 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX3P78415 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX3P78415 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX3P78415 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX3P78415 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX3P78415 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX3P78415 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX3P78415 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX3P78415 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX3P78415 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX3P78415 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX3P78415 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX3P78415 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX3P78415 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX3P78415 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX3P78415 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX3P78415 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX3P78415 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX3P78415 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX3P78415 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX3P78415 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX3P78415 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRX3P78415 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRX3P78415 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX3P78415 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX3P78415 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX3P78415 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX3P78415 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX3P78415 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX3P78415 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX3P78415 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX3P78415 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX3P78415 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX3P78415 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX3P78415 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX3P78415 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX3P78415 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX3P78415 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX3P78415 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX3P78415 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX3P78415 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX3P78415 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX3P78415 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX3P78415 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX3P78415 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX3P78415 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX3P78415 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX3P78415 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX3P78415 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX3P78415 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX3P78415 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX3P78415 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX3P78415 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX3P78415 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX3P78415 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX3P78415 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX3P78415 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX3P78415 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX3P78415 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX3P78415 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX3P78415 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX3P78415 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX3P78415 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX3P78415 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX3P78415 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX3P78415 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX3P78415 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX3P78415 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX3P78415 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX3P78415 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX3P78415 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX3P78415 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX3P78415 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX3P78415 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX3P78415 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms