Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA1P78396 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA1P78396 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA1P78396 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms