Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HBBP68871 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HBBP68871 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HBBP68871 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HBBP68871 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HBBP68871 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HBBP68871 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HBBP68871 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HBBP68871 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HBBP68871 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HBBP68871 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HBBP68871 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HBBP68871 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms