Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM4P67936 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM4P67936 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM4P67936 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM4P67936 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPM4P67936 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPM4P67936 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM4P67936 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM4P67936 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM4P67936 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM4P67936 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM4P67936 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM4P67936 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM4P67936 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPM4P67936 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM4P67936 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM4P67936 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM4P67936 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM4P67936 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM4P67936 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM4P67936 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM4P67936 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TPM4P67936 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPM4P67936 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPM4P67936 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPM4P67936 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPM4P67936 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM4P67936 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM4P67936 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM4P67936 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM4P67936 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM4P67936 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM4P67936 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM4P67936 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM4P67936 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPM4P67936 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM4P67936 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM4P67936 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM4P67936 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM4P67936 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM4P67936 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM4P67936 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM4P67936 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM4P67936 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM4P67936 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM4P67936 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM4P67936 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM4P67936 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM4P67936 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM4P67936 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM4P67936 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM4P67936 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM4P67936 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM4P67936 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM4P67936 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM4P67936 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms