Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-21P61565 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms