Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms