Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG3P56975 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG3P56975 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG3P56975 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG3P56975 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG3P56975 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG3P56975 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG3P56975 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG3P56975 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG3P56975 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG3P56975 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG3P56975 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG3P56975 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG3P56975 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG3P56975 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG3P56975 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG3P56975 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG3P56975 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRG3P56975 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRG3P56975 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRG3P56975 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRG3P56975 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG3P56975 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG3P56975 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG3P56975 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG3P56975 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG3P56975 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG3P56975 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG3P56975 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG3P56975 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG3P56975 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG3P56975 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG3P56975 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG3P56975 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG3P56975 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG3P56975 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG3P56975 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG3P56975 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG3P56975 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG3P56975 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG3P56975 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRG3P56975 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRG3P56975 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRG3P56975 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRG3P56975 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NRG3P56975 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRG3P56975 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRG3P56975 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms