Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP6P55212 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP6P55212 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP6P55212 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP6P55212 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP6P55212 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP6P55212 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP6P55212 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP6P55212 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP6P55212 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP6P55212 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP6P55212 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms