Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIRAP54198 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIRAP54198 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIRAP54198 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIRAP54198 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIRAP54198 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIRAP54198 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIRAP54198 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIRAP54198 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIRAP54198 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HIRAP54198 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIRAP54198 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIRAP54198 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIRAP54198 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIRAP54198 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIRAP54198 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIRAP54198 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HIRAP54198 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HIRAP54198 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIRAP54198 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIRAP54198 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIRAP54198 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HIRAP54198 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIRAP54198 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIRAP54198 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIRAP54198 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIRAP54198 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIRAP54198 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIRAP54198 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HIRAP54198 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HIRAP54198 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HIRAP54198 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIRAP54198 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIRAP54198 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIRAP54198 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIRAP54198 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIRAP54198 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HIRAP54198 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HIRAP54198 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIRAP54198 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIRAP54198 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HIRAP54198 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HIRAP54198 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HIRAP54198 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIRAP54198 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HIRAP54198 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIRAP54198 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIRAP54198 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIRAP54198 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIRAP54198 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIRAP54198 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIRAP54198 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRAP54198 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRAP54198 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRAP54198 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRAP54198 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRAP54198 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRAP54198 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRAP54198 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRAP54198 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRAP54198 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRAP54198 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRAP54198 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRAP54198 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRAP54198 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRAP54198 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRAP54198 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRAP54198 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
HIRAP54198 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIRAP54198 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIRAP54198 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRAP54198 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRAP54198 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRAP54198 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRAP54198 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRAP54198 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRAP54198 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRAP54198 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRAP54198 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRAP54198 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRAP54198 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms