Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A3P53794 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.9 ms