Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTBP53611 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
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