Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 GCV1YDR019C 1203 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 HPM1YIL110W 1134 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 LOH1YJL038C 660 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 FMP33YJL161W 543 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YKL169CYKL169C 384 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 CCS1YMR038C 750 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YNL296WYNL296W 315 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 ECM23YPL021W 564 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 BRE4YDL231C 3378 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 TRE1YPL176C 2352 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 HRK1YOR267C 2280 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 MET12YPL023C 1974 nt4.03□□□□□ -1.76
SYF2P53277 TPO2YGR138C 1845 nt4.03□□□□□ -1.76
SYF2P53277 BNA6YFR047C 888 nt4.03□□□□□ -1.76
SYF2P53277 RNA15YGL044C 891 nt4.03□□□□□ -1.76
SYF2P53277 RKM2YDR198C 1440 nt4.03□□□□□ -1.76
SYF2P53277 RAD52YML032C 1416 nt4.03□□□□□ -1.76
SYF2P53277 SBE2YDR351W 2595 nt4.02□□□□□ -1.77
SYF2P53277 OSW5YMR148W 447 nt4.02□□□□□ -1.77
SYF2P53277 CBP3YPL215W 1008 nt4.02□□□□□ -1.77
SYF2P53277 XKS1YGR194C 1803 nt4.02□□□□□ -1.77
SYF2P53277 HIS4YCL030C 2400 nt4.02□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YIL001WYIL001W 1542 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 SAC1YKL212W 1872 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 CYM1YDR430C 2970 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 LDB17YDL146W 1476 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 GDE1YPL110C 3672 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 COS6YGR295C 1146 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YJL218WYJL218W 591 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 TOM7YNL070W 183 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 ICY2YPL250C 411 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YGR266WYGR266W 2106 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YDL109CYDL109C 1944 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 SKG6YHR149C 2205 nt4.01□□□□□ -1.77
SYF2P53277 LAP2YNL045W 2016 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YLR125WYLR125W 411 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 CDC42YLR229C 576 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YGP1YNL160W 1065 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 OPY2YPR075C 1083 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 snR3snR3 194 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 BBC1YJL020C 3474 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 CDC48YDL126C 2508 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 JHD2YJR119C 2187 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 ARG4YHR018C 1392 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 GSY1YFR015C 2127 nt4□□□□□ -1.77
SYF2P53277 LYS2YBR115C 4179 nt3.99□□□□□ -1.77
SYF2P53277 TOM20YGR082W 552 nt3.99□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YLR122CYLR122C 378 nt3.99□□□□□ -1.77
SYF2P53277 TDA5YLR426W 981 nt3.99□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YNR042WYNR042W 429 nt3.99□□□□□ -1.77
SYF2P53277 NAT5YOR253W 531 nt3.99□□□□□ -1.77
SYF2P53277 CLB4YLR210W 1383 nt3.99□□□□□ -1.77
SYF2P53277 SMP1YBR182C 1359 nt3.99□□□□□ -1.77
SYF2P53277 MPH2YDL247W 1830 nt3.98□□□□□ -1.77
SYF2P53277 FAR10YLR238W 1437 nt3.98□□□□□ -1.77
SYF2P53277 ARP10YDR106W 855 nt3.98□□□□□ -1.77
SYF2P53277 SPR6YER115C 576 nt3.98□□□□□ -1.77
SYF2P53277 ISA1YLL027W 753 nt3.98□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YAR030CYAR030C 342 nt3.98□□□□□ -1.77
SYF2P53277 DIT1YDR403W 1611 nt3.98□□□□□ -1.77
SYF2P53277 VAC7YNL054W 3498 nt3.98□□□□□ -1.77
SYF2P53277 SEN1YLR430W 6696 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 RAM1YDL090C 1296 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 snR7-LsnR7-L 214 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 UBC6YER100W 753 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 ISY1YJR050W 708 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 SEC72YLR292C 582 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 CEG1YGL130W 1380 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 TIF4632YGL049C 2745 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 IBA57YJR122W 1494 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 TOG1YER184C 2385 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 TIP20YGL145W 2106 nt3.97□□□□□ -1.77
SYF2P53277 SKM1YOL113W 1968 nt3.96□□□□□ -1.77
SYF2P53277 OMS1YDR316W 1416 nt3.96□□□□□ -1.77
SYF2P53277 PML1YLR016C 615 nt3.96□□□□□ -1.78
SYF2P53277 YMR082CYMR082C 357 nt3.96□□□□□ -1.78
SYF2P53277 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt3.96□□□□□ -1.78
SYF2P53277 URE2YNL229C 1065 nt3.96□□□□□ -1.78
SYF2P53277 MMR1YLR190W 1476 nt3.96□□□□□ -1.78
SYF2P53277 GSH2YOL049W 1476 nt3.96□□□□□ -1.78
SYF2P53277 SEO1YAL067C 1782 nt3.96□□□□□ -1.78
SYF2P53277 ORC6YHR118C 1308 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 SAF1YBR280C 1914 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 APC1YNL172W 5247 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 YGR269WYGR269W 327 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 YJL220WYJL220W 453 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 RFC2YJR068W 1062 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 ACP1YKL192C 378 nt3.95□□□□□ -1.78
SYF2P53277 PBN1YCL052C 1251 nt3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.5 ms