Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SNT2	P53127	TSL1	YML100W	3297 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SNT2	P53127	FDC1	YDR539W	1512 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SNT2	P53127	YFR006W	YFR006W	1608 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SNT2	P53127	RPL22A	YLR061W	366 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SNT2	P53127	MRP21	YBL090W	534 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SNT2	P53127	YNR061C	YNR061C	660 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SNT2	P53127	TEL2	YGR099W	2067 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SNT2	P53127	AAD3	YCR107W	1092 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	ASC1	YMR116C	960 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	RPO31	YOR116C	4383 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	IMA1	YGR287C	1770 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	BRE4	YDL231C	3378 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	SOD1	YJR104C	465 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	PIR3	YKL163W	978 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	CWC27	YPL064C	906 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	ROD1	YOR018W	2514 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	UBP9	YER098W	2265 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	YLR446W	YLR446W	1302 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	VPS53	YJL029C	2469 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	SSU1	YPL092W	1377 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	MRP51	YPL118W	1035 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	ARX1	YDR101C	1782 nt		5.81	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	FHL1	YPR104C	2811 nt		5.81	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	HIS5	YIL116W	1158 nt		5.81	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	YOR008W-B	YOR008W-B	102 nt		5.81	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	OPY1	YBR129C	987 nt		5.81	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	FZF1	YGL254W	900 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	PBN1	YCL052C	1251 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	VID22	YLR373C	2706 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	YML131W	YML131W	1098 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	YIM1	YMR152W	1098 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	NUP1	YOR098C	3231 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	ERG7	YHR072W	2196 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	PRD1	YCL057W	2139 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	PEX30	YLR324W	1572 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	STE13	YOR219C	2796 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	AAP1	YHR047C	2571 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SNT2	P53127	AAD10	YJR155W	867 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	COG5	YNL051W	1212 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	CLF1	YLR117C	2064 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	PUB1	YNL016W	1362 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	ROG3	YFR022W	2202 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	RPA14	YDR156W	414 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	YPR174C	YPR174C	666 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	JEN1	YKL217W	1851 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	HXT7	YDR342C	1713 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	HXT6	YDR343C	1713 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	CRZ1	YNL027W	2037 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	RPL19B	YBL027W	570 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	RPG1	YBR079C	2895 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	SSM4	YIL030C	3960 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	YER077C	YER077C	2067 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	TFC7	YOR110W	1308 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	HO	YDL227C	1761 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	ACC1	YNR016C	6702 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	YTA7	YGR270W	4140 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	MET3	YJR010W	1536 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	HST1	YOL068C	1512 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	MRPL7	YDR237W	879 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	URA4	YLR420W	1095 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	GLO4	YOR040W	858 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	CHL1	YPL008W	2586 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	MSS1	YMR023C	1581 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	CST6	YIL036W	1764 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	RRN3	YKL125W	1884 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	DBF4	YDR052C	2115 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	YLR049C	YLR049C	1287 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	GAS3	YMR215W	1575 nt		5.71	□□□□□ -1.49
SNT2	P53127	YCR006C	YCR006C	474 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	TRM8	YDL201W	861 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	BNA1	YJR025C	534 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	YOR300W	YOR300W	309 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	BIK1	YCL029C	1323 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	YDR271C	YDR271C	372 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	JLP1	YLL057C	1239 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	YBL036C	YBL036C	774 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	YPL025C	YPL025C	558 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	BMT2	YBR141C	1014 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	POP4	YBR257W	840 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	ALG9	YNL219C	1668 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	PMA1	YGL008C	2757 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	EMP47	YFL048C	1338 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	COQ5	YML110C	924 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	CPA1	YOR303W	1236 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	EFM2	YBR271W	1260 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	GUP2	YPL189W	1830 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	YOR296W	YOR296W	3870 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	UBP10	YNL186W	2379 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	MAG1	YER142C	891 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	SFK1	YKL051W	1062 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	COX19	YLL018C-A	297 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	ISA1	YLL027W	753 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	NRK1	YNL129W	723 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	ATP4	YPL078C	735 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	FOL2	YGR267C	732 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	SNT1	YCR033W	3681 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	YPR022C	YPR022C	3402 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SNT2	P53127	PCL10	YGL134W	1302 nt		5.67	□□□□□ -1.5

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