Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms