Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A2P50993 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms