Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF6P49848 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF6P49848 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF6P49848 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF6P49848 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF6P49848 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF6P49848 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF6P49848 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF6P49848 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF6P49848 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF6P49848 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF6P49848 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF6P49848 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF6P49848 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF6P49848 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF6P49848 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF6P49848 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF6P49848 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF6P49848 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF6P49848 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF6P49848 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF6P49848 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF6P49848 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF6P49848 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF6P49848 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF6P49848 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF6P49848 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF6P49848 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF6P49848 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF6P49848 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF6P49848 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF6P49848 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF6P49848 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF6P49848 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF6P49848 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF6P49848 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF6P49848 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF6P49848 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF6P49848 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF6P49848 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF6P49848 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF6P49848 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF6P49848 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF6P49848 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF6P49848 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF6P49848 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF6P49848 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF6P49848 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF6P49848 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF6P49848 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF6P49848 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF6P49848 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF6P49848 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF6P49848 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF6P49848 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF6P49848 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF6P49848 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms