Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX1P48742 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX1P48742 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX1P48742 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX1P48742 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX1P48742 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX1P48742 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX1P48742 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX1P48742 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX1P48742 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX1P48742 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX1P48742 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX1P48742 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX1P48742 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX1P48742 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX1P48742 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX1P48742 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX1P48742 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX1P48742 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX1P48742 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX1P48742 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX1P48742 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX1P48742 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX1P48742 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX1P48742 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX1P48742 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX1P48742 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX1P48742 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX1P48742 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX1P48742 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX1P48742 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX1P48742 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX1P48742 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX1P48742 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX1P48742 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX1P48742 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX1P48742 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX1P48742 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX1P48742 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX1P48742 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX1P48742 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX1P48742 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX1P48742 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX1P48742 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX1P48742 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX1P48742 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX1P48742 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX1P48742 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX1P48742 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX1P48742 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX1P48742 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX1P48742 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX1P48742 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX1P48742 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX1P48742 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX1P48742 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX1P48742 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX1P48742 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX1P48742 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX1P48742 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX1P48742 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX1P48742 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX1P48742 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LHX1P48742 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX1P48742 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms