Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA8P48165 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA8P48165 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA8P48165 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA8P48165 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA8P48165 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA8P48165 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA8P48165 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA8P48165 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA8P48165 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA8P48165 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA8P48165 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA8P48165 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA8P48165 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA8P48165 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA8P48165 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA8P48165 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA8P48165 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA8P48165 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA8P48165 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA8P48165 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA8P48165 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA8P48165 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA8P48165 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA8P48165 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA8P48165 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA8P48165 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA8P48165 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA8P48165 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA8P48165 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA8P48165 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA8P48165 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA8P48165 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA8P48165 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA8P48165 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA8P48165 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA8P48165 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA8P48165 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA8P48165 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA8P48165 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA8P48165 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA8P48165 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms