Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA4P48058 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms