Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTRNP46939 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTRNP46939 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTRNP46939 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTRNP46939 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTRNP46939 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTRNP46939 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTRNP46939 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTRNP46939 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UTRNP46939 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UTRNP46939 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UTRNP46939 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UTRNP46939 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UTRNP46939 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UTRNP46939 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UTRNP46939 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UTRNP46939 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UTRNP46939 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UTRNP46939 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UTRNP46939 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UTRNP46939 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UTRNP46939 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UTRNP46939 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UTRNP46939 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UTRNP46939 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UTRNP46939 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UTRNP46939 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UTRNP46939 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UTRNP46939 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UTRNP46939 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTRNP46939 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UTRNP46939 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UTRNP46939 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UTRNP46939 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UTRNP46939 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UTRNP46939 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UTRNP46939 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UTRNP46939 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UTRNP46939 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UTRNP46939 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UTRNP46939 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UTRNP46939 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UTRNP46939 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UTRNP46939 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UTRNP46939 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UTRNP46939 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UTRNP46939 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UTRNP46939 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UTRNP46939 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UTRNP46939 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UTRNP46939 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UTRNP46939 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UTRNP46939 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UTRNP46939 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UTRNP46939 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms