Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQLP46063 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQLP46063 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQLP46063 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQLP46063 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQLP46063 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQLP46063 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQLP46063 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQLP46063 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQLP46063 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQLP46063 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQLP46063 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQLP46063 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQLP46063 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQLP46063 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQLP46063 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQLP46063 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQLP46063 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQLP46063 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQLP46063 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQLP46063 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQLP46063 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQLP46063 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQLP46063 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQLP46063 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQLP46063 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQLP46063 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQLP46063 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQLP46063 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQLP46063 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQLP46063 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQLP46063 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQLP46063 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQLP46063 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQLP46063 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQLP46063 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQLP46063 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQLP46063 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQLP46063 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQLP46063 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQLP46063 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQLP46063 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQLP46063 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQLP46063 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQLP46063 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQLP46063 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQLP46063 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQLP46063 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQLP46063 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQLP46063 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQLP46063 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQLP46063 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQLP46063 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQLP46063 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms