Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA4P41247 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA4P41247 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA4P41247 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms