Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5CP41229 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms