Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.15□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.15□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.15□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.15□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.15□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.15□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.15□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.15□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.15□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.15□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 SSM4YIL030C 3960 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 RPO31YOR116C 4383 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 KIN3YAR018C 1308 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 RCM1YNL022C 1473 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 YSF3YNL138W-A 258 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 GPP1YIL053W 753 nt5.13□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 SUI1YNL244C 327 nt5.13□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 POP4YBR257W 840 nt5.13□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 PPQ1YPL179W 1650 nt5.13□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 YER077CYER077C 2067 nt5.13□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 DUG1YFR044C 1446 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 TEL2YGR099W 2067 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 CLF1YLR117C 2064 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 GUP2YPL189W 1830 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 UBP13YBL067C 2244 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 SSH1YBR283C 1473 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 TPS3YMR261C 3165 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 YIM1YMR152W 1098 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 SNT1YCR033W 3681 nt5.11□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 APC1YNL172W 5247 nt5.11□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 UBP10YNL186W 2379 nt5.11□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 YEL045CYEL045C 426 nt5.11□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 ODC2YOR222W 924 nt5.11□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 IMA1YGR287C 1770 nt5.1□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 BBC1YJL020C 3474 nt5.1□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 MMT1YMR177W 1533 nt5.1□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 PRD1YCL057W 2139 nt5.1□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 MAD2YJL030W 591 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 RPS19AYOL121C 435 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-2P40105 YEL057CYEL057C 702 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 YGR018CYGR018C 330 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 HAL5YJL165C 2568 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 YBR225WYBR225W 2703 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 YTA7YGR270W 4140 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 SEG2YKL105C 3399 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 FOB1YDR110W 1701 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 KRE9YJL174W 831 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 YAR061WYAR061W 204 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 GLO4YOR040W 858 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 MRP51YPL118W 1035 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 AAP1YHR047C 2571 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 PEX29YDR479C 1665 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 CTT1YGR088W 1689 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 KAP114YGL241W 3015 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 PUB1YNL016W 1362 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 BRE4YDL231C 3378 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 PIM1YBL022C 3402 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 YGR017WYGR017W 894 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 TEF4YKL081W 1239 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 ISA1YLL027W 753 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 RAD14YMR201C 1116 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 ARC40YBR234C 1155 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 HRK1YOR267C 2280 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 RPL19BYBL027W 570 nt5.06□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 ASC1YMR116C 960 nt5.06□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 HEM15YOR176W 1182 nt5.06□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 PMA1YGL008C 2757 nt5.06□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 PEX30YLR324W 1572 nt5.06□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 VPS53YJL029C 2469 nt5.06□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 VID22YLR373C 2706 nt5.06□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 ELO2YCR034W 1044 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 YKR104WYKR104W 921 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 SUB2YDL084W 1341 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 JIP5YPR169W 1479 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 JEN1YKL217W 1851 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 YPR022CYPR022C 3402 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 AAD10YJR155W 867 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 FHL1YPR104C 2811 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 ERG7YHR072W 2196 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 GAS3YMR215W 1575 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 PIR3YKL163W 978 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 KTR2YKR061W 1278 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 CAT5YOR125C 702 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 ARG4YHR018C 1392 nt5.03□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 TSL1YML100W 3297 nt5.03□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 FOL2YGR267C 732 nt5.03□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 YML131WYML131W 1098 nt5.03□□□□□ -1.6
YRF1-2P40105 PCL10YGL134W 1302 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 OPY1YBR129C 987 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 PBN1YCL052C 1251 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 SKG6YHR149C 2205 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 PFK1YGR240C 2964 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 HIS5YIL116W 1158 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 MET3YJR010W 1536 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 MRT4YKL009W 711 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 YMR084WYMR084W 789 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 MRH4YGL064C 1686 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 YMR130WYMR130W 909 nt5□□□□□ -1.61
YRF1-2P40105 OLE1YGL055W 1533 nt5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 93.5 ms