Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD12P35452 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms