Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms