Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSPOP30536 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TSPOP30536 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPOP30536 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPOP30536 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPOP30536 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPOP30536 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPOP30536 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPOP30536 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPOP30536 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPOP30536 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPOP30536 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPOP30536 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPOP30536 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPOP30536 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPOP30536 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPOP30536 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPOP30536 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPOP30536 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPOP30536 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPOP30536 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPOP30536 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPOP30536 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPOP30536 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPOP30536 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPOP30536 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms