Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMGB2P26583 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HMGB2P26583 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms