Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTX3P26022 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTX3P26022 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTX3P26022 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTX3P26022 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTX3P26022 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTX3P26022 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTX3P26022 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTX3P26022 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTX3P26022 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTX3P26022 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTX3P26022 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTX3P26022 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTX3P26022 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTX3P26022 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTX3P26022 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTX3P26022 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTX3P26022 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTX3P26022 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTX3P26022 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTX3P26022 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTX3P26022 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTX3P26022 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTX3P26022 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTX3P26022 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTX3P26022 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTX3P26022 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTX3P26022 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTX3P26022 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTX3P26022 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTX3P26022 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms