Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE1P24864 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms