Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms