Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.115e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ACTR6-209ENST00000551617 1715 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.125e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ACTR6-210ENST00000551652 582 ntTSL 37.84□□□□□ -1.155e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 SNAP23-220ENST00000568841 632 ntTSL 37.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 PIN4-207ENST00000496835 678 ntTSL 27.04□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 PIN4-205ENST00000439980 577 ntTSL 46.8□□□□□ -1.321e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ARHGAP19-205ENST00000487035 4553 ntTSL 26.75□□□□□ -1.335e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 NDUFB3-203ENST00000450023 462 ntTSL 36.73□□□□□ -1.335e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ACTR6-204ENST00000548180 1747 ntTSL 26.63□□□□□ -1.355e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.355e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.425e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 SNAP23-209ENST00000563873 368 ntTSL 34.64□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ACTR6-211ENST00000552064 780 ntTSL 33.44□□□□□ -1.865e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 SNAP23-205ENST00000563333 862 ntTSL 21.74□□□□□ -2.132e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.165e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 SNAP23-207ENST00000563765 855 ntTSL 31.45□□□□□ -2.182e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 SNAP23-208ENST00000563830 570 ntTSL 51.13□□□□□ -2.232e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 EMC7-203ENST00000528949 506 ntTSL 30.59□□□□□ -2.312e-10■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ST6GAL1-220ENST00000470633 4893 ntTSL 27.11□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ST6GAL1-209ENST00000442023 570 ntTSL 45.41□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 32.8
RPS3P23396 ISG15-202ENST00000624652 657 ntTSL 316.68■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 32.8
RPS3P23396 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 32.8
RPS3P23396 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 32.8
RPS3P23396 SCARB2-204ENST00000509994 545 ntTSL 49.71□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 32.8
RPS3P23396 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 32.8
RPS3P23396 PCOLCE-208ENST00000487172 686 ntTSL 219.09■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 32.8
RPS3P23396 SERPINC1-202ENST00000487183 626 ntTSL 28.04□□□□□ -1.122e-9■■■■■ 32.8
RPS3P23396 PCOLCE-206ENST00000482863 545 ntTSL 414.95□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 32.8
RPS3P23396 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.058e-53■■■■■ 32.7
RPS3P23396 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.046e-9■■■■■ 32.7
RPS3P23396 POLR2A-205ENST00000576114 245 ntTSL 26.84□□□□□ -1.317e-8■■■■■ 32.7
RPS3P23396 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.354e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.124e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.664e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.644e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HINT2-204ENST00000472085 569 ntTSL 324.4■■□□□ 1.54e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HINT2-206ENST00000474908 2167 ntTSL 1 (best)23.72■■□□□ 1.394e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.342e-8■■■■■ 32.6
RPS3P23396 TM2D3-209ENST00000560013 1868 ntTSL 223.34■■□□□ 1.334e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HINT2-202ENST00000461169 734 ntTSL 222.2■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.122e-8■■■■■ 32.6
RPS3P23396 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.024e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 12e-8■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-204ENST00000373966 1875 ntTSL 521.22■□□□□ 0.994e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-218ENST00000489522 561 ntTSL 521.17■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 NUBP2-209ENST00000566090 708 ntTSL 220.94■□□□□ 0.948e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.894e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 P3H1-210ENST00000463465 897 ntTSL 320.47■□□□□ 0.874e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.854e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 GSTM3-205ENST00000488824 1118 ntTSL 220.33■□□□□ 0.854e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)19.99■□□□□ 0.792e-67■■■■■ 32.6
RPS3P23396 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.784e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 YIPF2-208ENST00000589971 879 ntTSL 219.88■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.764e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-207ENST00000460181 2206 ntTSL 1 (best)19.48■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 NUBP2-210ENST00000566447 511 ntTSL 419.37■□□□□ 0.698e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 YIPF2-203ENST00000586575 932 ntTSL 519.37■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.674e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-208ENST00000467826 829 ntTSL 519.12■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-203ENST00000373963 1657 ntTSL 519.08■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 NUBP2-204ENST00000563821 2235 nt18.9■□□□□ 0.628e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ATG101-204ENST00000550604 671 ntTSL 318.88■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-217ENST00000488506 649 ntTSL 518.83■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL21-206ENST00000544567 654 ntTSL 318.74■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-202ENST00000322176 925 ntTSL 318.55■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ATG101-203ENST00000548915 658 ntTSL 318.47■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-218ENST00000521459 714 ntTSL 518.4■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL46-205ENST00000560703 670 ntTSL 317.76■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ATG101-207ENST00000553049 846 ntTSL 217.69■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 PEPD-212ENST00000593163 1045 ntTSL 217.52■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DNPEP-206ENST00000429013 896 ntTSL 517.3■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-220ENST00000497386 1060 ntTSL 217.12■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 YIPF2-212ENST00000592646 950 ntTSL 317.07■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL21-207ENST00000565125 2283 ntTSL 516.96■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 YIPF2-205ENST00000587943 796 ntTSL 516.93■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ATG101-205ENST00000552544 837 ntTSL 216.93■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 HINT2-205ENST00000474848 853 ntTSL 216.86■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 FPGS-216ENST00000488307 1172 ntTSL 516.78■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 RNASEH2A-204ENST00000593017 1487 ntTSL 215.57■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ALAS1-206ENST00000493402 758 ntTSL 315.3■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 32.6
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