Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGFR4P22455 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms