Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BGNP21810 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BGNP21810 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BGNP21810 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BGNP21810 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BGNP21810 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BGNP21810 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BGNP21810 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BGNP21810 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BGNP21810 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BGNP21810 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BGNP21810 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BGNP21810 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BGNP21810 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BGNP21810 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BGNP21810 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BGNP21810 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BGNP21810 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BGNP21810 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BGNP21810 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BGNP21810 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BGNP21810 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BGNP21810 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BGNP21810 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BGNP21810 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BGNP21810 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BGNP21810 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BGNP21810 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BGNP21810 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BGNP21810 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BGNP21810 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BGNP21810 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BGNP21810 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BGNP21810 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BGNP21810 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BGNP21810 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BGNP21810 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BGNP21810 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BGNP21810 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BGNP21810 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BGNP21810 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BGNP21810 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BGNP21810 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BGNP21810 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BGNP21810 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BGNP21810 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms