Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMNB1P20700 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNB1P20700 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNB1P20700 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMNB1P20700 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMNB1P20700 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNB1P20700 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNB1P20700 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LMNB1P20700 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMNB1P20700 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LMNB1P20700 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMNB1P20700 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LMNB1P20700 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMNB1P20700 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMNB1P20700 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMNB1P20700 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMNB1P20700 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMNB1P20700 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMNB1P20700 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMNB1P20700 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LMNB1P20700 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMNB1P20700 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMNB1P20700 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB1P20700 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB1P20700 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB1P20700 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB1P20700 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB1P20700 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms