Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDE6GP18545 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDE6GP18545 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDE6GP18545 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PDE6GP18545 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PDE6GP18545 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6GP18545 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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