Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GM2AP17900 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GM2AP17900 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GM2AP17900 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GM2AP17900 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GM2AP17900 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GM2AP17900 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GM2AP17900 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GM2AP17900 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GM2AP17900 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GM2AP17900 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GM2AP17900 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GM2AP17900 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GM2AP17900 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GM2AP17900 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GM2AP17900 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GM2AP17900 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GM2AP17900 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GM2AP17900 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GM2AP17900 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GM2AP17900 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GM2AP17900 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GM2AP17900 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GM2AP17900 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GM2AP17900 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GM2AP17900 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GM2AP17900 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GM2AP17900 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GM2AP17900 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GM2AP17900 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GM2AP17900 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms