Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF3P17036 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms