Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFAP15692 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFAP15692 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFAP15692 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFAP15692 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFAP15692 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VEGFAP15692 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFAP15692 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFAP15692 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFAP15692 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VEGFAP15692 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFAP15692 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFAP15692 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VEGFAP15692 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFAP15692 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFAP15692 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFAP15692 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFAP15692 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFAP15692 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFAP15692 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFAP15692 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFAP15692 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFAP15692 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFAP15692 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFAP15692 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFAP15692 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFAP15692 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFAP15692 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFAP15692 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFAP15692 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFAP15692 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFAP15692 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VEGFAP15692 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFAP15692 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFAP15692 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFAP15692 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFAP15692 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFAP15692 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VEGFAP15692 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms