Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRF1P14222 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRF1P14222 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRF1P14222 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRF1P14222 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRF1P14222 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRF1P14222 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRF1P14222 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRF1P14222 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRF1P14222 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRF1P14222 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRF1P14222 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRF1P14222 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRF1P14222 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRF1P14222 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRF1P14222 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRF1P14222 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRF1P14222 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRF1P14222 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRF1P14222 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRF1P14222 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRF1P14222 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRF1P14222 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRF1P14222 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRF1P14222 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRF1P14222 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRF1P14222 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRF1P14222 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRF1P14222 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRF1P14222 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRF1P14222 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRF1P14222 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRF1P14222 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRF1P14222 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRF1P14222 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRF1P14222 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRF1P14222 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRF1P14222 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRF1P14222 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRF1P14222 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRF1P14222 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRF1P14222 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms