Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL11A1P12107 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1566.6 ms