Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRFP11831 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRFP11831 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRFP11831 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRFP11831 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRFP11831 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRFP11831 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRFP11831 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRFP11831 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRFP11831 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRFP11831 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRFP11831 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRFP11831 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRFP11831 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRFP11831 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRFP11831 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRFP11831 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SRFP11831 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRFP11831 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRFP11831 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRFP11831 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRFP11831 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRFP11831 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRFP11831 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRFP11831 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRFP11831 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRFP11831 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRFP11831 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRFP11831 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRFP11831 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRFP11831 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRFP11831 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRFP11831 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRFP11831 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRFP11831 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRFP11831 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRFP11831 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRFP11831 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRFP11831 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRFP11831 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRFP11831 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRFP11831 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRFP11831 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFP11831 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFP11831 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFP11831 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFP11831 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFP11831 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFP11831 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFP11831 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFP11831 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFP11831 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFP11831 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFP11831 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFP11831 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFP11831 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFP11831 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFP11831 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFP11831 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFP11831 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFP11831 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFP11831 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFP11831 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFP11831 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFP11831 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFP11831 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFP11831 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFP11831 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFP11831 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFP11831 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFP11831 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms