Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2MP0CAP2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2MP0CAP2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms