Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBBP07437 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBBP07437 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBBP07437 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBBP07437 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBBP07437 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBBP07437 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBBP07437 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBBP07437 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBBP07437 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBBP07437 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBBP07437 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBBP07437 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBBP07437 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBBP07437 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBBP07437 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBBP07437 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBBP07437 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBBP07437 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBBP07437 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBBP07437 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBBP07437 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBBP07437 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBBP07437 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBBP07437 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBBP07437 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBBP07437 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBBP07437 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBBP07437 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBBP07437 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBBP07437 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBBP07437 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBBP07437 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBBP07437 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBBP07437 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBBP07437 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBBP07437 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBBP07437 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBBP07437 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBBP07437 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBBP07437 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBBP07437 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBBP07437 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBBP07437 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBBP07437 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBBP07437 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBBP07437 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBBP07437 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBBP07437 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBBP07437 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBBP07437 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBBP07437 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBBP07437 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBBP07437 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBBP07437 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBBP07437 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBBP07437 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms