Protein–RNA interactions for Protein: P06731

CEACAM5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM5P06731 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM5P06731 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM5P06731 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms