Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA2P02652 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA2P02652 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA2P02652 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA2P02652 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA2P02652 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA2P02652 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA2P02652 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA2P02652 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA2P02652 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA2P02652 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA2P02652 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA2P02652 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA2P02652 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA2P02652 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA2P02652 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA2P02652 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA2P02652 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA2P02652 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA2P02652 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA2P02652 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA2P02652 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA2P02652 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA2P02652 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA2P02652 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA2P02652 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA2P02652 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA2P02652 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA2P02652 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA2P02652 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA2P02652 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA2P02652 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA2P02652 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA2P02652 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA2P02652 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA2P02652 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA2P02652 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA2P02652 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA2P02652 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA2P02652 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms