Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE6O95741 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE6O95741 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms