Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP4O95707 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP4O95707 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP4O95707 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP4O95707 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP4O95707 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP4O95707 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POP4O95707 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POP4O95707 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP4O95707 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP4O95707 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP4O95707 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP4O95707 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP4O95707 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP4O95707 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP4O95707 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP4O95707 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP4O95707 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP4O95707 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP4O95707 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP4O95707 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POP4O95707 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP4O95707 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP4O95707 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP4O95707 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POP4O95707 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP4O95707 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP4O95707 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP4O95707 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP4O95707 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP4O95707 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP4O95707 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP4O95707 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP4O95707 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP4O95707 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP4O95707 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP4O95707 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP4O95707 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP4O95707 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP4O95707 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP4O95707 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP4O95707 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP4O95707 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP4O95707 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms